生物信息学科学家/工程师(SR.)

通用测序技术公司

生物信息学科学家/工程师(SR.)

广州,马
全职
有薪酬的
  • 职责

    职位描述

    (实际标题取决于经验)

    通用测序技术公司是一家位于San Diego的一个分支机构的Biotech公司,正在寻找一个生物信息学软件工程师加入团队。此职位是为公司的新技术工作的独特机会,用于下一代测序(NGS)平台,可实现许多以前不可成立的应用程序。该人将引领基因组数据分析算法的发展和数值数据模拟,以解决一个或多个NGS生物信息学区的挑战基因组学问题,例如单倍型相位,结构变异检测,de Novo组装,偏心组织和靶测序/临床生物信息学以及单细胞测序分析。使用序列对准,文本索引和搜索,基因组组装,图形算法,组合优化和概率理论,理想的候选者将在NGS数据分析中具有强大的背景。

    除了强大的编程技能之外,候选人必须对生物学的敏锐兴趣并与现实世界的数据合作。强大的人际关系能力,渴望了解基因组学研究员的需求和明确沟通结果的能力是必须的。该职位将与分子生物学中的同事密切联系。

    期望的技能:

    • C / C ++,Java,Python,Perl,shell脚本中的强大编程体验。
    • NGS DNA序列数据分析管道强大经验
    • 强大的体验在NGS基因组数据分析中开发生物信息学算法
    • 强大体验开发用于数值数据分析和仿真的工具
    • 与NGS数据分析工具有关经验(例如BWA,SAMTOOLS,SNP图,REFHAP,HAPCUT,绷带等)
    • 经验和释放商业或开源软件
    • 云计算中的经验和/或强烈知识(AWS)A Plus。

    义务和责任:

    • 分析内部生成的测序数据

    • 与内部和/或外部生物学家合作以了解应用和要求

    • 使用内部开发的算法设计和开发新的数据分析管道流程

    • 设计和开发软件,用于单倍型相位,结构变异检测和 德诺维 assembly

    • 调查和集成开源软件以与我们的专有技术一起使用

    • 与内部和/或外部用户一起使用,以根据我们的核心产品开发和支持定制解决方案

    • 积极参与SDLC的所有阶段,包括开发,测试,错误修复和用户支持。

    • 编写和维护良好的文档,例如软件规格,架构设计,测试计划和部署计划。

    • 其他工作和项目分配根据需要。

    资格:

    计算机科学,生物信息学或相关领域的博士学位,0-3年的博士后经验

    在计算机科学,生物信息学或相关领域的MSC,毕业后至少5年

    任何NGS生物信息学区的经验,如单倍型相位,结构变异检测,DE Novo组装和偏心组织以及靶序列和临床生物信息学

    单细胞测序分析中的经验是一个加号。

    在团队环境中独立工作

    能够在快节奏和快速变化的环境中工作